第一次淋病基因组调查显示了整个欧洲的抗生素

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  第一次淋病基因组调查显示了整个欧洲的抗生素耐药性

  2018年5月16日

  第一个欧洲范围内的淋病基因组调查显示,整个非洲大陆的这种性传播疾病都存在抗生素耐药性。基因组病原体监测中心(CGPS),欧洲疾病控制中心Wellcome Sanger研究所及其合作者的研究人员也表明,使用DNA测序数据,他们可以准确地确定抗生素耐药性并识别不正确的实验室检测结果。有一天,这种基因组方法可以帮助医生为每个地区开出最有效的抗生素。

  据“柳叶刀传染病”报道,该研究还建立了一个开放的淋病基因组数据库。新资源将支持全球范围内实时持续监测淋病,公共卫生官员可以使用这些监测来监测全球存在哪些淋病症以及新的抗生素耐药性出现的地方。

  淋病是全球第二大流行的细菌性传播感染(STI),是由淋病奈瑟氏球菌(Neisseria gonorrhoeae)引起的。世卫组织估计,每年全球有8,800万人感染淋病。除其他并发症外,如果不及时治疗,可引起盆腔炎和不孕症,并且在某些情况下会导致危及生命的并发症,如脑膜炎。在无保护性行为期间传播,由于抗生素耐药性的增加,许多淋病症现在难以治疗。

  为了解多药耐药菌株的程度并确定最佳的监测方法,研究人员研究了2013年从欧洲20个国家收集的1054个N. gonorrheae样本。每个样本在当地进行了类型和抗生素敏感性测试,并被送到DNA提取中心实验室。然后对DNA进行测序,并在基因组病原体监测中心对数据进行分析,并通过其在线平台进行访问,创建了第一个欧洲范围的淋病数据库。

  科学家们发现,使用基因组数据可以比现有的分型技术更准确地识别临床上重要的抗生素耐药菌株,并确定不正确的实验室抗生素耐药性结果。

  该论文的通讯作者兼Wellcome Sanger研究所基因组病原体监测中心主任David Aanensen教授说:“我们是迄今为止最全面,最全面的淋病基因组研究,全球医疗保健工作者都可以获得数据。

   比较和观察新出现的淋病菌株。这种新方法与可访问的数据库和解释工具的结合提供了整个欧洲淋病菌株和抗生素耐药性的基因组基线,这将加强对淋病的实时监测。

  相关故事评论:抗生素的发展有所增加,但不充分提供有关医生如何处方药物的更多信息可能会减少过量处方抗生素抗性超级细菌已经到达ArcticDr Simon Harris,来自Wellcome Sanger研究所的论文的第一作者说:“我们的研究表明,目前用于分类淋病菌株的方法对于监测不是非常有效。我们表明,全基因组测序可以真实地反映出敏感和耐药菌株在哪里传播,这将使医生能够快速发现新的抗生素抗性淋病菌株的出现。今年开始的后续研究将显示图片如何随时间变化。“

  Web应用程序可在线公开获取,来自世界各地的医疗保健官员可以使用它并添加自己的基因组数据。这将使他们能够监测每个地理区域出现的菌株和抗生素耐药性。正在进行的监测将使诊所能够提供最合适的抗生素,并有助于延缓抗生素耐药性的进一步发作。

  Gianfranco Spiteri博士是欧洲疾病预防和控制中心协调欧洲淋球菌抗菌药物监测计划(Euro-GASP)的论文的作者,他说:“抗药性细菌正在成为巨大的公共卫生威胁。为了控制它们,我们迫切需要新工具来识别和跟踪新的感染和抗生素耐药菌株。这种新方法将允许欧洲范围内的淋病基因组监测,直接影响国家一级的感染控制,并有助于预防淋病。这种方法也可以扩展到其他感染。

  来源:HTTPS://www.sanger.ac.uk/news/view/gonorrhoea-surveillance-study-maps-antibiotic-resistance-across-europe